De opheffing van Hamburg Freihafen is niet zonder problemen verlopen. Aanvullende maatregelen zijn nodig om een concurrentienadeel ten opzichte van Rotterdam ongedaan te maken.

Sinds de overgangsfase op 1 december 2012 van start ging is de douaneafhandeling langduriger geworden en doen zich op de containerterminals in Hamburg af en toe chaotische taferelen voor, volgens een comité dat zich van meet af aan heeft verzet tegen de opheffing van de Freihafen.